昆明市食品药品检验所（昆明市食品药品检验研究院）质量管理体系文件制定于2012年，分别于2014年、2016年、2020年、2025年进行了四次改版,现行体系文件为第五版，由《质量手册》《程序文件》《作业指导书》（含综合篇、食品篇和药品篇）《记录表格》（含综合篇、食品篇和药品篇）组成，于2025年5月1日正式实施。

本版质量管理体系文件满足：

《检验检测机构资质认定管理办法》（2015年4月9日国家质量监督检验检疫总局令第163号令公布，根据2021年4月2日国家市场监督管理总局令第38号公布，第一次修改），简称“163号令修正案”。

《检验检测机构监督管理办法》（2021年4月8日国家市场监督管理总局令第39号公布，根据2025年3月18日国家市场监督管理总局令第101号修订）

《食品检验机构资质认定条件》（食药监科〔2016〕106号）

CNAS-CL01:2018《检测和校准实验室能力认可准则》

CNAS-CL01-G001:2024《CNAS-CL01《检测和校准实验室能力认可准则》应用要求》

CNAS-CL01-A001:2022《检测和校准实验室能力认可准则在微生物检测领域的应用说明》

CNAS-CL01-A002:2020《检测和校准实验室能力认可准则在化学检测领域的应用说明》》

CNAS-CL01-A024:2018《检测和校准实验室能力认可准则在基因扩增领域的应用说明》